کرونا

کرونا و یا کووید-19 زندگی ما را تغییر داده است، بسیار ناگهانی و به شیوه‌ای چشمگیر که هرگز تصورش را نمی‌کردیم.

در این مقاله سعی داریم اطلاعاتی با هدف مشترک: ایمن ماندن، فعال نگه داشتن آزمایشگاه‌های ضروری در سراسر جهان و همکاری در مبارزه با COVID-19  بدهیم

درک ابزار SARS-CoV-2 برای دانش بیشتر

Understanding SARS

در مبارزه با COVID-19، دانش قدرت است. درک بهتر ویروس SARS-CoV-2 برای توسعه درمان ها و واکسن ها ضروری است. با این حال، همانطور که ویروس ها پیش می روند، خانواده کروناویروس بسیار پیچیده است.

اولین بار در دهه 1960 شناسایی شد، دانشمندان با استفاده از میکروسکوپ الکترونی یک ویروس کروی با سطح میخ دار را دیدند که تا حدودی شبیه تاج خورشیدی بود – و بنابراین اصطلاح “کرونا ویروس” ابداع شد. کروناویروس‌ها با قطر حدود 125 نانومتر با ژنوم RNA 30000 باز، بدون شک بزرگ و به خوبی مسلح هستند.

این خانواده از ویروس‌ها مدت‌هاست که باعث ایجاد بیماری‌های شدید و مرگ در طیفی از گونه‌های جانوری می‌شوند و انسان‌ها تنها با شیوع سارس در سال 2003 به فهرست رو به رشد اضافه شدند.

اکنون، در بحبوحه همه‌گیری کرونا SARS-CoV-2، کشندگی این ویروس‌ها به خوبی ثابت شده است.

با پیشرفت علم و فناوری بیش از هر زمان دیگری، تیم‌های جهانی از محققان برای درک بهتر ویروس، توسعه واکسن‌ها و طراحی درمان‌هایی با سرعت در حال رقابت هستند.

هر سه این حوزه ها با چالش های تحلیلی خاص خود همراه هستند

علت اصلی بیماریزایی SARS-CoV-2 گلیکوپروتئین spike آن است.

این گلیکوپروتئین با استفاده از گیرنده آنزیم تبدیل کننده آنژیوتانسین انسانی (hACE2) به سلول های هدف متصل شده و وارد آن می شود و به یک hot target برای واکسن ها، درمان ها و کاندیدهای تشخیصی تبدیل شده است.

این پروتئین spike  به شدت گلیکوزیله شده است و بسیاری بر این باورند که گلیکان ها نقش کلیدی در بیماریزایی دارند.

درک جامع از گلیکوپروتئین، از جمله مکان و هویت گلیکان‌های فردی، برای توسعه درمان‌ها حیاتی خواهد بود.

تیمی در کمپانی Agilent در حال حاضر از نزدیک با کنسرسیوم ژنومیک ساختاری (SGC) در دانشگاه آکسفورد برای کمک به توسعه روش‌های قوی و قابل اعتماد برای تجزیه و تحلیل پروتئین اسپایک SARS-CoV-2 بر اساس این رویکردها، همکاری می‌کند.

این تیم با استفاده از تخصص ما در علم جداسازی، تجزیه و تحلیل گلیکان و طیف‌سنجی جرمی، در حال توسعه راه‌حل‌های مبتنی بر LC/MS برای بهبود درک علمی پروتئین اسپایک و حمایت از تولیدکنندگان گلیکوپروتئین برای تحقیقات بیشتر است.

توسعه واکسن COVID-19 و دستگاههای انالیتیکال شیمی تجزیه مبتنی بر جداسازی

با توجه به گستردگی همه‌گیری کنونی، جای تعجب نیست که محققان در سراسر جهان برای یافتن واکسن SARS-COV-2 در حال رقابت هستند.

  چهار دسته اصلی از نامزدهای واکسن وجود دارد که در حال پیگیری هستند، اما یک نکته مشترک این رویکردها استفاده از روش‌های کروماتوگرافی و طیف‌سنجی جرمی برای توصیف آنها است.

در این مقاله، نمونه‌هایی از هر کلاس واکسن را بررسی می‌کنیم که در آن جداسازی کروماتوگرافی در تعیین خصوصیات واکسن‌ها کمک کرده است.

واکسن های ویروسی

مثال: واکسن سرخک، واکسن فلج اطفال

فرض: واکسن های ویروسی برای ایجاد واکسن، اشکال ضعیف یا ضعیف شده ویروس را می گیرند.

این ویروس‌های ضعیف شده نمی‌توانند برای فرد بیماری ایجاد کنند، اما وقتی به سیستم ایمنی فرد ارائه می‌شوند، همچنان می‌توانند پاسخ ایمنی را برانگیزند.

این به سیستم ایمنی فرد حافظه از پاتوژن می دهد (به عنوان مثال، ایمنی) اگر در تاریخ بعدی شکل کاملاً فعال ویروس را ببیند.

  استفاده از کروماتوگرافی size exclusion chromatography (SEC) برای جداسازی ذرات ویروسی دست نخورده از پروتئین های کپسید متلاشی شده را توصیف می کند و از کروماتوگرافی تبادل یونی  ion exchange chromatography  (IEX) برای خالص سازی بیشتر محصول استفاده می کند.

واکسن ناقل ویروسی

مثال: واکسن ابولا

فرض: یک ویروس به عنوان یک ناقل و مهندسی ژنتیکی برای تولید پروتئین از یک پاتوژن دیگر برای ایجاد ایمنی استفاده می شود. وکتورها vectors  می توانند تکرار شونده یا غیر تکرار شونده باشند.

روش های مورد استفاده: کروماتوگرافی تبادل آنیونی (AEX)، نوعی IEX، . برای تعیین کپسیدهای کامل و خالی AAV6.

واکسن های اسید نوکلئیک

مثال‌ها: در حالی که هیچ واکسن فعلی دارای مجوز انسانی از این روش استفاده نمی‌کند، بیش از 20 گروه تحقیقاتی روی واکسن‌هایی در این دسته کار می‌کنند.

مقدمه: این تکنیک از مواد DNA یا RNA از پاتوژن استفاده می کند که پروتئینی را که باعث پاسخ ایمنی می شود کد می کند.

روش‌های مورد استفاده: در بررسی تکنیک‌های خالص‌سازی واکسن‌های DNA، تیمی از دانشگاه کانبرا طیف وسیعی از تکنیک‌ها را از کروماتوگرافی میل ترکیبی تا کروماتوگرافی برهمکنش آبگریز affinity chromatography to hydrophobic interaction chromatography (HIC) برای خالص‌سازی پلاسمیدهای DNA برای واکسن‌ها پوشش دادند.

تیم دیگری به رهبری کاترین لنکستر الگوهای N-گلیکان گلیکوپروتئین ویروس Chikungunya را مشخص کردند، مشابه کارهایی که برای گلیکوپروتئین اسپایک SARS-CoV-2 مورد نیاز است.

  کیت های گلیکان آزاد اکنون برای اطمینان از بالاترین سطح تکرارپذیری و سرعت برای کار بیشتر در دسترس هستند.

واکسن های مبتنی بر پروتئین

مثال: واکسن هپاتیت B، واکسن ویروس پاپیلومای انسانی (HPV).

مقدمه: این واکسن‌ها معمولاً بر اساس زیرواحدهای پروتئین ویروسی یا ذرات ویروس مانند (VLP) هستند و با تزریق مستقیم پروتئین‌ها به بدن کار می‌کنند.

این به بدن اجازه می دهد تا به جای ویروس کامل، پروتئین را تشخیص دهد و پاسخ ایمنی به آن بدهد.

روش های مورد استفاده: استفاده از کروماتوگرافی حذف اندازه size exclusion chromatography (SEC) به عنوان ابزاری برای واکسن های مبتنی بر پروتئین توسط سانتانا و همکاران نشان داده شده است، جایی که آنها از فناوری BioSec-3 برای تعیین مقدار شکل فعال هماگلوتینین جدید (HA) استفاده می کنند. در واکسن آنفولانزا استفاده می شود.

2020 سالی بود که خیلی چیزها را در زندگی روزمره خود بدیهی می‌دانستیم به طرز چشمگیری تغییر کرد.

  ما از هجوم سریع COVID-19 شوکه شدیم، از انزوا و از دست دادن زندگی غمگین شدیم، از زمانی که بی عدالتی نژادی طولانی مدت به ناآرامی های مدنی سرایت کرد، وحشت کردیم و آسیب دیدیم، و نگران بودیم که بحران جهانی آب و هوا بزرگتر از همیشه ظاهر شد.

توسعه دارویی COVID-19: مروری بر داروهای تجویزی درمانی

خلاصه مقالات منتشر شده در مورد داروهای مولکولی کوچک که برای درمان کووید-19 تغییر کاربری داده اند

چندین داروی ضد ویروسی موجود که برای HIV/AIDS، مالاریا، سندرم تنفسی خاورمیانه (MERS) و سندرم تنفسی حاد شدید (SARS) استفاده می‌شوند، در حال حاضر به عنوان درمان‌های COVID-19 در حال تحقیق هستند.

برخی از آنها قبلاً برای درمان COVID-19 به آزمایشات بالینی منتقل شده اند.

 همانطور که توسط نویسنده شارلوت هریسون در کانتربری، بریتانیا بیان شد، “ضد ویروس‌ها و دانش به‌دست‌آمده از شیوع سارس و مرس به عنوان سریع‌ترین راه برای مبارزه با اپیدمی کروناویروس کنونی مورد توجه قرار می‌گیرد.”

به همین ترتیب وینسنت مانستر، رئیس واحد اکولوژی ویروسی در مؤسسه ملی بهداشت ایالات متحده، خاطرنشان کرد: «طرح کلی ژنومی و سینتیک‌های تکثیر کلی و زیست‌شناسی ویروس‌های MERS، SARS، و [SARS-CoV-2] بسیار هستند. مشابه، بنابراین آزمایش داروهایی که بخش‌های نسبتاً ژنریک این ویروس‌ها را هدف قرار می‌دهند، یک گام منطقی است.

برای داروهای با مولکول کوچک مانند ضد ویروس ها، آنتی بیوتیک ها یا ضدانگل ها، فرآیند کشف، سنتز و تولید دارو به طور کلی شامل سه مرحله است.

اولین بازده ماده فعال در دارو، منجر به کشف و سنتز ماده فعال می شود.

دومی دارو را طوری تغییر می دهد که پایدار باشد و به راحتی توسط بدن جذب شود.

سومین مورد شامل بسته بندی دارو (به عنوان مثال، در قرص یا ویال) است.

در اینجا خلاصه‌ای سریع از مقالات مجلات منتشر شده توسط نویسندگان مختلف در مورد داروهای مولکولی کوچک که برای درمان کووید-19 در آزمایش‌های بالینی در سراسر جهان استفاده می‌شوند، ارائه می‌کنیم.

رمدسیویر

ضد ویروس؛ آنالوگ آدنوزین نوکلئوتید مهار کننده سنتز RNA در کروناویروس ها

در این مطالعه DMPK، نمونه‌های پلاسما پروتئین رسوب داده شدند و از طریق صفحه فیلتر 0.2 میکرومتری Agilent Captiva 96 فیلتر شدند. نمونه ها بر روی یک UPLC همراه با طیف سنجی جرمی چهار قطبی سه گانه تجزیه و تحلیل شدند

این بیماری همه گیر در چند ماه گذشته تغییرات زیادی کرده است، اما تصمیم و نبوغ دانشمندان در سراسر جهان را تغییر نداده است.

محققان در هر گوشه از جهان به طور خستگی ناپذیری روی ساخت واکسنی برای کروناویروس جدید 2019 کار کرده اند.

جوامع تحقیقاتی علمی و پزشکی در تلاش های خستگی ناپذیر خود برای یافتن نه تنها یک واکسن، بلکه سایر درمان های موثر مانند داروهای ضد ویروسی، مهارکننده های پپتید، آنالوگ های نوکلئوزیدی، و آنتی بادی های مونوکلونال متحد هستند.

چه چیزی در یک واکسن وجود دارد؟

در تئوری، یک واکسن ساده است: ماده ای (مانند یک ویروس کشته یا ضعیف شده) معرفی می شود که بدون بیمار کردن بیمار، پاسخ ایمنی ایجاد می کند.

این سیستم ایمنی را برای حمله به پاتوژن‌های مشابه، تقویت می‌کند و در مقابل بیماری ایمنی ایجاد می‌کند.

شروع جستجو

اندکی پس از شیوع اولیه ویروس کرونا در دسامبر 2019، چین توالی ژنتیکی کروناویروس جدید را به اشتراک گذاشت.

این تلاش‌ها به همراه ساخت واکسن قبلی برای سندرم حاد تنفسی شدید (SARS) که بین 80 تا 90 درصد توالی ژنتیکی آن با کروناویروس جدید مشترک است، به محققان و شرکت‌ها کمک کرده است تا توسعه واکسن را تسریع کنند.

یکی از شرکت‌هایی که به این مبارزه کمک می‌کند، BioTek (اکنون بخشی از Agilent) است که مجموعه‌ای از ابزارهای آن برای تصویربرداری، تشخیص و آنالیز مایعات، پردازش هزاران نمونه (از جمله توزیع انبوه ترکیب اصلی ( مستر میکس )  bulk dispensation of PCR master mix) را تسریع می‌کند.

یکی از ابزارهای BioTek، MultiFlo FX، برای توزیع Master Mix RT-PCR RNA و غلظت RNA از نمونه ها استفاده می شود.

RNA استخراج شده به عنوان پایه ای برای اکثر تحقیقات COVID-19 عمل می کند

دستگاه مولتی مود ریدر چند حالته چند منظوره MultiFlo™ FX BioTek بسیاری از کارهای معمول liquid handling از dispensing گرفته تا plate washing و media exchange را در یک سیستم ماژولار فشرده اتوماتیک انجام می دهد .

امیکرون Omicron

در 26 نوامبر 2021، WHO بر اساس توصیه گروه مشاوره فنی سازمان جهانی بهداشت در مورد تکامل ویروس (TAG-VE)، نوع B.1.1.529 را به عنوان یک نوع نگران کننده به نام Omicron تعیین کرد.

در 26 نوامبر 2021، WHO بر اساس توصیه گروه مشاوره فنی سازمان جهانی بهداشت در مورد تکامل ویروس (TAG-VE)، نوع B.1.1.529 را به عنوان یک نوع نگران کننده به نام Omicron تعیین کرد.

این تصمیم بر اساس شواهد ارائه شده به TAG-VE مبنی بر اینکه Omicron دارای جهش های متعددی است که ممکن است بر نحوه رفتار آن تأثیر بگذارد، به عنوان مثال، بر نحوه انتشار آسان یا شدت بیماری که ایجاد می کند.

در اینجا خلاصه ای از آنچه در حال حاضر شناخته شده است آمده است.

دانش فعلی در مورد Omicron

محققان در آفریقای جنوبی و در سراسر جهان در حال انجام مطالعاتی برای درک بهتر بسیاری از جنبه های Omicron هستند و به اشتراک گذاری یافته های این مطالعات در صورت در دسترس شدن ادامه خواهند داد.

قابلیت انتقال: هنوز مشخص نیست که آیا Omicron در مقایسه با انواع دیگر، از جمله دلتا، قابل انتقال تر است (به عنوان مثال، راحت تر از فردی به فرد دیگر منتقل می شود). تعداد افرادی که آزمایششان مثبت شده است در مناطقی از آفریقای جنوبی که تحت تأثیر این نوع قرار گرفته اند افزایش یافته است، اما مطالعات اپیدمیولوژیک در حال انجام است تا بفهمیم که آیا این به دلیل Omicron یا عوامل دیگر است.

شدت بیماری: هنوز مشخص نیست که آیا عفونت با Omicron باعث بیماری شدیدتر در مقایسه با سایر انواع از جمله دلتا می شود یا خیر.

داده های اولیه حاکی از آن است که میزان بستری شدن در بیمارستان در آفریقای جنوبی رو به افزایش است، اما این ممکن است به دلیل افزایش تعداد کلی افراد آلوده باشد، نه به دلیل عفونت خاص با Omicron.

در حال حاضر هیچ اطلاعاتی وجود ندارد که نشان دهد علائم مرتبط با Omicron با سایر انواع متفاوت است.

   عفونت‌های گزارش‌شده اولیه در میان دانشجویان دانشگاه بود – افراد جوان‌تری که تمایل به بیماری خفیف‌تری دارند – اما درک میزان شدت نوع Omicron روزها تا چند هفته طول می‌کشد.

  همه انواع کووید-19، از جمله نوع دلتا که در سراسر جهان غالب است، می‌تواند باعث بیماری شدید یا مرگ شود، به‌ویژه برای آسیب‌پذیرترین افراد، و بنابراین پیشگیری همیشه کلیدی است.

اثربخشی عفونت قبلی SARS-CoV-2

شواهد اولیه نشان می‌دهد که ممکن است خطر عفونت مجدد با Omicron افزایش یابد (یعنی افرادی که قبلاً COVID-19 داشته‌اند می‌توانند راحت‌تر با Omicron مجدداً آلوده شوند)، در مقایسه با سایر انواع نگران‌کننده، اما اطلاعات محدود است.

اثربخشی واکسن‌ها: سازمان جهانی بهداشت با شرکای فنی برای درک تأثیر بالقوه این نوع بر اقدامات متقابل موجود ما، از جمله واکسن‌ها، کار می‌کند.

 واکسن‌ها برای کاهش بیماری‌های شدید و مرگ، از جمله در برابر نوع غالب در گردش، دلتا، حیاتی هستند.

واکسن های فعلی در برابر بیماری های شدید و مرگ موثر باقی می مانند.

اثربخشی آزمایش‌های فعلی: آزمایش‌های PCR که به‌طور گسترده مورد استفاده قرار می‌گیرند، همچنان برای تشخیص عفونت، از جمله عفونت با Omicron، همچنان که در مورد انواع دیگر نیز دیده‌ایم، ادامه می‌دهند.

مطالعات برای تعیین اینکه آیا تأثیری بر انواع دیگر آزمایش‌ها از جمله آزمایش‌های تشخیص سریع آنتی‌ژن وجود دارد یا خیر ادامه دارد.

اثربخشی درمان‌های فعلی: کورتیکواستروئیدها Corticosteroids و مسدودکننده‌های گیرنده Receptor Blockers IL6 همچنان برای مدیریت بیماران مبتلا به COVID-19 شدید مؤثر خواهند بود.

سایر درمان‌ها برای بررسی اینکه آیا با توجه به تغییرات بخش‌هایی از ویروس در نوع Omicron هنوز به همان اندازه مؤثر هستند، ارزیابی خواهند شد.

اخبار کرونا

ویروس کرونا

بیماری ویروس کرونا

کلیدواژه:کرونا,امیکرون,PCR,ویروس کرونا,کرونا ویروس,کرونا دلتا,کرونا امیکرون,دلتا,واکسن,بیماری ویروس کرونا,اخبار کرونا,